基因集富集分析 (Gene Set Enrichment Analysis, GSEA）
GSEA（Gene Set Enrichment Analysis），该方法发表于2005年的Gene set enrichment analysis: a knowledge-based approach forinterpreting genome-wide expression profiles，是一种基于基因集的富 …
GSEA 分析可以用来研究哪些生物学问题？ - 知乎
GSEA（Gene Set Enrichment Analysis）分析是一种常用的基因集富集分析方法，它能够帮助生物学家探索差异表达基因在某些生物过程或通路中的富集情况，从而为深入研究生物学问题提供重要线索。 …
如何使用正确的基因集合进行 GSEA 分析？ - 知乎
要进行 GSEA 分析，您需要准备几部分的数据：1）预定义的基因集；2）所有样本的所有基因表达矩阵；3）样品的分组信息。 预定义的基因集就像 KEGG 中某条 pathway 中对应哪些基因一样，GSEA …
如何解读 gsea 分析结果？ - 知乎
我们此部分一共有两个函数，一个是KS_GSEA，作用是进行转录组数据GSEA分析，提供clusterProfiler和fgsea两种R包分析方式，KS_GSEA适用于human和mouse两个物种，支持KEGG …
GSEA如何分析，生物上的大神帮帮忙? - 知乎
GSEA结果解读 第1部分是Enrichment Score的折线图 横轴排序后的基因，纵轴为对应的Running ES, 在折线图中出现的峰值就是这个基因集的富集分数（Enrichment Score，ES）。
单细胞测序中GO、KEGG、GSEA 分析三个高级分析有什么区别？ - 知乎
大家好，诺禾致源科技服务专注组学技术十三载，您身边可信赖的科研合作伙伴，为您提供全面产品解决方案。 单细胞测序中GO、KEGG、GSEA分析是三种常用的高级分析方法，它们各有特点和应用场 …
单细胞测序中GO、KEGG、GSEA 分析三个高级分析有什么区别？ - 知乎
总结 1.数据基础：GO和KEGG分析通常基于差异表达基因，而GSEA分析基于所有基因的表达数据。 2.分析侧重点：GO侧重于基因的功能注释和分类，KEGG侧重于基因在生物通路中的参与情 …
如何创建自己的GSEA基因集？ - 知乎
总之，GSEA是一种强大的分析大规模基因表达数据的方法，能够识别出哪些通路和生物进程在不同的组间中差异调控，更好的了解观察到的基因表达变化的生物机制。 这个是GSEA的官网，首先需要下 …
富集分析中，“ORA”、“超几何分布”、“ GSEA”是什么意思，它们之间有 …
GSEA将多个基因视作一个整体（基因集），并且与这些基因的上、下调差异联系起来。 (GSEA和超几何分布都能在网上搜索到详细的解答过程）。
单细胞测序中 GSEA、GSVA 两个高级分析有哪些相同和不同处呢？ - 知乎
你好，解答如下： GSVA分析背景： GSEA是用来判断其对表型的贡献的分析，但是应用场景通常局限于 Case-Control 型实验设计。对于表型（分组）复杂的大样本量研究，GSEA已不能满足对大量异质性 …